Marķieri ir sadalīti divos veidos: ūdens bāzes un eļļas bāzes.
Līdzīgi kā krāsainas pildspalvas, pildspalvas uz ūdens bāzes nav toksiskas, bet tās nav viegli nožūt. Un pārklājums nav labs, dažu priekšmetu virsmu nevar uzrakstīt, un abas krāsas izskatīsies netīras, kad tās būs sakrautas kopā.
Pildspalvas uz eļļas bāzes ir sintētiski šķīdinātāji, kas izmanto alkoholu, lai izšķīdinātu krāsu, un daži jutīgi cilvēki jutīsies reibinoši, kad viņi to smaržos. Bet tas ir viegli rakstīt un nožūt, tam ir labs pārklājums un tas ir lētāks.
Ir arī daži marķieri, kas nāk ar augļu smaržu.
